个人简介：

  中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员，合成生物进化研究中心主任，中国遗传学会进化遗传学分会和中国生物信息学会网络生物学专委会委员。入选国家青年科学基金A类项目（原国家杰青）、海外高层次青年人才项目和广东省杰青，主持国家重点研发计划课题、国自然医学专项、中科院-香港裘褨基金会联合实验室等项目。通讯作者或一作（含共同）论文发表在Nature、Nature Biotechnology、Nature Genetics (3篇)、Genome Biology、Cell Systems等期刊。研究成果入选2023年和2024年中国生物信息学十大进展。受邀在美国癌症研究协会年会（AACR 2024）等国际会议做口头报告。

  学习经历:

  2010/9-2015/6 中国科学院北京基因组研究所 博士

  2006/9-2010/6 华中科技大学生命科学与技术学院 本科

  工作经历:

  2020/4-至今 中国科学院深圳先进技术研究院 研究员

  2015/8-2020/4 美国斯坦福大学 博士后

（1）新型高分辨单细胞谱系追踪技术的开发;

（2）谱系追踪与单细胞组学多模态数据融合算法的开发；

（3）消化道癌前病变的起源和致癌演变机制解析；

（4）肿瘤转移与耐药的表型可塑性与适应性演化规律解析。

1.Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution. Nature(2024)(通讯)

2.Clonal expansion dictates the efficacy of mitochondrial lineage tracing in single cells. Genome Biology(2025)(通讯)

3.Single-cell phylodynamic inference of stem cell differentiation and tumor evolution. Cell Systems(2025)(通讯)

4.PhyloVelo enhances transcriptomic velocity field mapping using monotonically expressed genes. Nature Biotechnology(2023)(通讯)

5.A Genetic Bottleneck of Mitochondrial DNA During Human Lymphocyte Development. Molecular biology and evolution(2022)(通讯)

6.Immune-tumor interaction dictates spatially directed evolution of esophageal squamous cell carcinoma. National Science Review(2024)(通讯)

7.Looking backward in time to define the chronology of metastasis. Nature Communications(2020)(通讯)

8.Single-cell mitochondrial lineage tracing: Opportunities and challenges. Quantitative Biology(2025)(通讯)

国际影响力：

AACR 2024年会特邀报告，National Science Review杂志生命科学组编委

所获荣誉：

2023年和2024年中国生物信息学十大进展、欧洲癌症研究协会十佳论文奖、美国创新基因组研究所博士后奖等奖项。

科研项目：

1. 细胞谱系重构与动态解析，国家自然科学基金A类项目，2026/1-2030/12，400万，主持（在研）

2.小鼠细胞命运决定过程中基因表达网络的数学建模和关键模式识别，国家重点研发计划，2022/4-2027/3,754万，课题负责人(在研)

3.肺癌脑转移趋向性的关键细胞亚群、演化规律和临床预测模型研究(联合申请B)，2023/1-2025/12，国家基金委专项，200万，主持(在研)

4.针对高噪音基因组测序数据的肿瘤演化推断算法开发及其应用研究，国家基金委面上基金，2023/1-2026/12, 54万，主持(在研)

5. 单细胞谱系示 踪解析脑胶质瘤化疗耐药的分子与演化机制，中国科学院-香港裘槎基金会联合实验室，2024/10- 2027/9, 240万元, 主持(在研)